偏头痛作为一大类临床常见疾病，治疗的药物有很多，虽然很多药物都宣称能治疗偏头痛，实际还没有一种药物能够有效地达到偏头痛的根治。但是，仍然有很多的药物可以用来治疗达到临床治愈。
比如头痛发作的时候给患者镇痛药，例如含有对乙酰基酚成分的镇痛药物以及感冒药，这是一个对症治疗的药物，往往也是比较有效，但是不能长期服用，可以在发作期短期使用，长期大量使用副作用就会出现了。
第二类，就是改善头部的神经血管功能的药物，目前副作用比较小且比较有针对性的是曲普坦类药物，包括佐米曲普坦、舒马曲普坦、苯甲酸利扎曲普坦等，这一类的药物主要是在血管和神经发生异常功能障碍的时候，通过对神经和血管的调节改善异常的血管扩张状态，从而终止头痛的发作。此前曾广泛使用的麦角胺咖啡因，因心血管方面的副作用，目前已经较少使用。
在偏头痛的治疗里面，有一些药物，规律按疗程应用，可以预防血管的异常收缩及后续的扩张，同时避免形成发作→疼痛→敏化→发作的恶性循环，常用的有钙离子拮抗剂氟桂利嗪及尼莫地平。另一类是β受体阻滞剂如倍他乐克，这两类的药通过改善血管工作状态，来达到长期预防的目的。这些药物是预防性用药，需要在非发作期就要开始用药。
还有一类是抗惊厥类的治疗神经痛药物，代表药物有普瑞巴林及加吧喷丁，这一类的药物通过规律性应用，也可以从减少神经敏感性，减少神经血管功能异常角度，对偏头痛进行治疗，这类药物在发作期和缓解期都可以应用，形成对偏头痛的预防和治疗。
还有一大类药就是祖国医学里边的中药，中医理论通过辨证施治，根据痛则不通、通则不痛等理论指导，采用补肾阴阳、活血化瘀这一类作用的中药，经过治疗以后患者也能够取到非常好的效果。
温馨提示，这些偏头痛治疗药物都不能说是有根治性的，只是对于特定的一部分人群有效果。有些情况下，尤其是顽固的多年的偏头痛，可以和疼痛科的星状神经节阻滞等微创治疗结合，则会提高临床的治愈率。